La factura clínica tiene reglas fiscales únicas por exención IVA servicios médicos y RGPD datos salud. Evita errores aplicando IVA mal o incumpliendo Verifactu (QR obligatorio incluso exentas).
Clínicas emiten factura clínica adaptada a pacientes, aseguradoras o empresas, respetando confidencialidad. Software especializado genera exenciones, formatos aseguradoras y Verifactu seguro.
Exención IVA servicios sanitarios
Base legal
La exención de IVA para servicios sanitarios está regulada en el artículo 20.Uno.3º de la Ley del IVA (Ley 37/1992), que cubre asistencia a personas físicas por profesionales médicos o sanitarios titulados, independientemente del pagador o estructura empresarial (autónomos o sociedades).
Incluye servicios de diagnóstico, prevención, tratamiento y rehabilitación de enfermedades, como consultas médicas, intervenciones quirúrgicas terapéuticas, hospitalización y análisis clínicos, incluso si se prestan a través de sociedades mercantiles.
Servicios exentos
Están exentos de IVA consultas médicas generales y especializadas, intervenciones quirúrgicas reparadoras, servicios de enfermería hospitalaria o domiciliaria, análisis clínicos de laboratorio, rehabilitación médica postoperatoria y exploraciones radiológicas o pruebas funcionales realizadas por profesionales reconocidos.
Esta exención aplica aunque el destinatario sea una empresa, mutua o aseguradora, siempre que el servicio sea materialmente prestado por médico o sanitario con titulación oficial.
Servicios NO exentos
No están exentos servicios de medicina estética no reparadora (blanqueamientos dentales cosméticos), cirugía plástica voluntaria puramente estética, tratamientos de bienestar o spa médico, ni venta directa de productos como órtesis en ortopedia (salvo vinculados directamente a asistencia terapéutica).
Estos llevan IVA general (21%) y deben discriminarse claramente en la factura clínica para evitar reclamaciones de Hacienda o inspecciones.
La factura exenta de IVA
Requisitos
La factura clínica exenta debe indicar explícitamente «Operación exenta de IVA» citando el artículo 20.Uno.3º LIVA, no mostrar cuota de IVA (solo base imponible), cumplir Verifactu con QR verificable y conservar registro íntegro 4 años.
Incluye datos obligatorios: emisor (NIF, nombre clínica, dirección), receptor (si aplica), fecha emisión, número correlativo único, concepto genérico y total sin IVA.
Ejemplo
FACTURA Nº 2026/001
Clínica Dental Ejemplo SL – NIF: B12345678
Fecha: 15/02/2026
Concepto: Tratamiento ortodoncia correctiva
Base imponible: 1.500,00 €
IVA: Exento (Art. 20.Uno.3º LIVA)
TOTAL: 1.500,00 €
[CÓDIGO QR VERIFACTU]
Facturación a diferentes pagadores
Paciente particular
Para pacientes particulares que pagan directamente, la factura clínica va a nombre personal con datos mínimos (nombre, DNI opcional), respetando confidencialidad absoluta: concepto genérico sin diagnóstico ni historia clínica.
Factura simplificada posible si importe <400€ y no solicitan completa, pero siempre con QR Verifactu y registro Hacienda.
Compañía aseguradora
Facturación a aseguradoras requiere factura clínica nominativa a la compañía, con asegurado como mera referencia y formato específico (codificación actos médicos, campos obligatorios).
Solo datos estrictamente necesarios para cobro y conciliación, sin historia clínica detallada.
Empresas (reconocimientos)
Reconocimientos médicos laborales facturan a empresa como servicio B2B estándar, sin detalles individuales empleados por LOPD y confidencialidad profesional.
Verifactu en el sector salud
Obligación aplicable
Clínicas privadas y médicos autónomos deben usar software homologado Verifactu desde julio 2026 (sociedades mercantiles) o 2027 (autónomos), con QR en toda factura clínica exenta o no, y registros íntegros enviados a AEAT.
Conservación 4 años obligatoria, con encadenamiento inalterable.
Factura simplificada
Posible en consultas rutinarias <400€, pero con QR Verifactu y datos mínimos; factura completa si paciente/aseguradora lo solicita explícitamente.
Protección datos en facturas médicas
Sensibilidad especial
Datos salud son categoría especial RGPD (art. 9), requiriendo protección máxima en factura clínica con base legal reforzada (prestación servicios sanitarios o contrato).
Confidencialidad extrema, consentimiento explícito para compartición aseguradoras.
Qué incluir en la factura
Concepto genérico («servicios médicos generales»), sin diagnósticos, tratamientos sensibles o historia clínica; solo datos fiscales necesarios para cobro.
Software para el sector sanitario
Requisitos específicos
Software factura clínica debe cumplir Verifactu/RGPD, integrar gestión pacientes (agenda, historial anonimizado) y formatos aseguradoras específicas.
Facturación a mutuas y aseguradoras
Proceso habitual
Aseguradoras exigen formatos codificados (actos médicos), plazos presentacion estrictos y conciliación detallada.
Conciliación
Controlar pagos, rechazos y plazos cobro para flujo caja óptimo.
Errores frecuentes
Aplicar IVA servicios exentos (multas Hacienda).
No aplicar IVA estética reparadora.
Incluir datos médicos sensibles (sanciones RGPD).
Confundir destinatario (paciente vs aseguradora).
Caso práctica: clínica dental
Situación
Clínica 50 pacientes/semana: mitad particulares (simplificadas), mitad asegurados (formatos específicos); tratamientos estéticos con IVA 21%.
Gestión con El Equipo IA
Exentas automáticas médicas, IVA estética, formatos aseguradoras, simplificadas particulares, todo Verifactu/RGPD.
Conclusiones
Factura clínica combina exención IVA selectiva, pagadores complejos y RGPD estricto; software homologado especializado simplifica gestión diaria evitando riesgos.
